يوجد في مخيم الحسينية العديد من المساجد التي تعرضت للتدمير والقصف، لكن تم إعادة تأهيل وترميم بعضها مثل مسجد خليل الرحمن ومسجد الصحابي زاهر بن حرام، وتعمل منظمات إغاثية على ترميم المزيد منها ضمن مشاريع إعادة تأهيل البنية التحتية، وكان من المساجد التي تعرضت للقصف أيضاً جامع عائشة وجامع سيدنا يعقوب عليه السلام. 

المساجد التي تم ترميمها وإعادة افتتاحها:

• مسجد خليل الرحمن: تم ترميمه من قبل هيئة الإغاثة العالمية والهيئة الخيرية لإغاثة الشعب الفلسطيني في أواخر عام 2015.
• مسجد الصحابي زاهر بن حرام: تم ترميمه وافتتاحه بعد مسجد خليل الرحمن ضمن نفس المشروع في أوائل 2016. 

مساجد تعرضت للقصف (قبل 2015):

• جامع عبد الرحمن خليل: قصف في 30/6/2015.
• مسجد زاهر: قصف في نفس اليوم.
• جامع عائشة: قصف في 1/1/2013.
• جامع سيدنا يعقوب عليه السلام. 

الوضع العام للمساجد:

• تتضمن جهود إعادة الإعمار ترميم المساجد والمنازل المتضررة في المخيم، بهدف تشجيع عودة السكان وتعزيز استقرار المخيم، وفقاً لمجموعة العمل من أجل فلسطينيي سوريا